Puerto Rico nu are companii aeriane nationale. Transportatorii majori cu zboruri zilnice spre Puerto Rico includ American Airlines, Continental, Delta, JetBlue si US Airways.

Pentru a vizita orasul San Juan, cautati un zbor catre Aeroportul International Juan Luis Munoz. Cele mai ieftine perioade pentru a zbura catre Puerto Rico sunt cele de la sfarsitul primaverii si inceputul verii. Tarifele sunt de obicei mai mari in timpul iernii, in special in jur de Ziua Recunostintei, de Craciun si de Anul Nou.

Portul de la San Juan este in prezent cel mai mare port al insulei, primind atat marfa cat si nave de croaziera.