Muzeul Sanatatii din Edirne a fost construit de sultanul Baiazid al II-lea, incepand cu anul 1488, in doar patru ani. De-a lungul timpului, numerosi studenti la medicina si-au facut aici ucenicia. Erau tratatate in special afectiunile oftalmologice. Spitalul a acordat asistenta atat suferinzilor cat si persoanelor fara adapost.

Incepand cu anul 1850 se constata o decadere din punctul de vedere al conservarii cladirii, astfel incat, spitatul se transforma in ospiciu. De asemenea, cladirea a fost inundata in repetate randuri de revarsarea raului Tunca. Spitalul este revigorat ca urmare a razboiului ruso-turc 1877-1878, cand, aici, sunt ingrijiti ranitii sositi de pe front. Dar, in 1896, este transformat din nou in ospiciu. Abia in anul 1910, sub indrumarea arhitectului german Cornalius, spitalul este renovat. Odata cu intrarea spitalului in posesia Universitatii Trakya, in anul 1933, a inceput si procesul de transformare spitalului in Muzeu al Sanatatii.