Muzeul Maritim Egeean din Mykonos si-a deschis portile in anul 1985 si este gazduit intr-o cladire cicladica traditionala ce a apartinut unui capitan din secolul al XIX-lea din centrul orasului Mykonos in apropierea Tria Pigadia (Trei Puturi), langa Muzeul Casa Lena. Scopul muzeului este sa prezinte si sa studieze istoria traditiei nautice grecesti.
Exponatele din interiorul si exteriorul muzeului includ modele detaliate de nave din perioada minoica timpurie si pana la inceputul secolului XX cum ar fi modele la scara a unor diferite nave cu vasle, corabii cu panze si vapoare cu aburi ce au traversat Marea Egee din vremuri Preistorice si pana in prezent. Aici gasim, de asemenea, o colectie bogata de monede antice ce infatiseaza scene maritime, documente istorice de transport maritim, picturi, printuri, gravuri si harti rare, precum si obiecte si instrumente de navigatie antice. Biblioteca muzeului consta in 5.000 de carti rare si o arhiva interesanta de manuscrise si fotografii. Gradina prezinta descoperiri din marmura din Insula Delos si Insula Mykonos, o referinta la epave si la marinarii care au fost pierduti pe mare.

Muzeul Maritim Egeean din Mykonos a fost primul muzeu grecesc care a restaurat importante exponate istorice, cum ar fi Farul Armenistis din Mykonos construit in anul 1890, corabia „Evangelistria” lansata la apa in anul 1940 (ancorata in vechiul port vara de vara unde poate fi vizitate de turistii interesati) si nava de plasare a cablurilor pentru comunicatii „Thalis o Milesios” realizata in anul 1909.

In zilele noastre, Muzeul Maritim Egeean se alatura constant conferintelor internationale, expozitiilor si participa frecvent la Saptamana Maritima din Grecia. Muzeul este deschis din luna Aprilie si pana in luna Octombrie, zilnic intre orele 10:30-13:00 si 18:00-21:00.