Muzeul Provincial de Istorie Naturala Mediteraneana din Livorno (Museo Provinciale di Storia Naturale del Mediterraneo) a fost fondat in anul 1929, pe baza materialului stiintific abundent din Cabinetul de Istorie Naturala al Institului Tehnic Amerigo Vespucci, care a fost adunat din 1871 pana in 1900, de catre naturalisti ilustri din Livorno. In timpul bombardamentelor din anul 1944 patrimoniul naturalist a fost distrus. Dupa razboi, muzeul a fost transferat la Acvariul Municipal si in 1952 a fost redeschis pentru public.

In 1980, muzeul a fost in cele din urma transferat la locatia de astazi, in Vila Henderson, unde cladirea principala, complet restructurata, gazduieste sediul institutiei.

Astazi Muzeul de Istorie Naturala Marea Mediterana se poate defini ca un centru de cercetare capabil de a conduce si elaborarea de programe care vor proteja si conserva patrimoniul natural, un centru de stiinta culturala orientat spre formarea unei constiinte naturaliste, o structura culturala deschisa lucrarilor si activitatilor grupurilor de studiu spontane, un centru pentru activitati scolare de invatamant.

Datorita finantarii furnizate de UE, au putut fi terminate llucrarile de restructurare din cadrul muzeului. Proiectul arhitectural elaborat de Giuseppe Milanesi a inclus constructia camerei cetaceelor, a gradinii botanice, si restructurarea cladirilor intr-un centru de educatie si zone de divertisment.