Muzeul National de Arheologie din Florenta este situat in Piazza Santissima Annunziata, in Palazzo della Crocetta - un palat construit in anul 1620 de catre Giulio Parigi pentru printesa Maria Maddalena de Medici, fiica lui Ferdinand I de Medici.

Muzeul a fost inaugurat in prezenta regelui Victor Emmanuel al II-lea in 1870, in cladirile apartinand Cenacolo di Fuligno pe Via Faenza. La acel moment aceste continea numai ramasite etrusce si romane. Pe masura ce colectiile au crescut, o noua locatie a devenit imperios necesara, iar in 1880 muzeul a fost transferat in cladirea in care se afla si astazi. Colectia a fost initial fondata prin donatii ale familiilor Medici si Lorena, cu mai multe transferuri de la Uffizi pana la 1890. O prima parte a sectiunii egiptene a fost formata in prima jumatate a secolului al XVIII-lea pe baza colectiei lui Leopold de Toscana, cealalta parte provenind de la o expeditie in Egipt promovata de acelasi Leopold intre anii 1828-1829 si condusa de Ippolito Rosellini si Champollion - primul om care a descifrat hieroglifele. In 1887 a fost adaugata sectiunea etrusca, aceasta fiind insa distrusa de inundatiile din 1966.

Colectia camerei etrusce a fost reexaminata si reorganizata in 2006. Tot atunci a fost facuta si restaurarea asteptata timp de 40 de ani a celor peste 2000 de obiecte deteriorate in inundatiile din 1966. Mare colectie de ceramica veche este expusa intr-o camera mare cu numeroase vitrine la etajul al doilea. In general, vasele provin din morminte etrusce si sunt o dovada a schimbului cultural si comercial, cu Grecia, si, in special cu Atena, unde cele mai multe vase au fost facute, obiectele datand din perioada cuprinsa intre secolul IV i.Hr. si pana in prezent.

Sectiunea egipteana a colectiei este cunoscuta sub numele de Muzeul Egiptean, si este cea mai mare a doua colectie de artefacte egiptene din Italia, dupa cea a muzeului Egizio din Torino. Prima colectie din Florenta de antichitati egiptene a fost colectia Medici, datand din secolul al optsprezecelea. In secolul al XIX-lea, Leopold al II-lea a inceput achizitionarea de artefacte acum adapostite la Muzeul Egiptean. Impreuna cu Charles al X-lea al Frantei, el a finantat o expeditie stiintifica in Egipt, intre anii 1828 - 1829. Expeditia a fost condusa de Jean-François Champollion. Ippolito Rosellini, prieten si student al lui Champollion, a reprezentat interesele italiene in timpul expeditiei. Multe artefacte au fost colectate in timpul expeditiei, atat din sapaturi arheologice, precum si prin achizitiile de la comerciantii locali. La intoarcerea lor, acestea au fost distribuite in mod egal intre muzeul Luvru din Paris si noul Muzeul Egiptean din Florenta.