Paneriai este situat la aproximativ 10 kilometri distanta de centrul orasului Vilnius. Acesta este cel mai mare oras din municipalitatea orasului Vilnius.

Orasul Paneriai este situat pe o zona cu dealuri joase si impadurite. Paneriai a fost locul unde a avut loc masacrul de la Ponarz, o ucidere in masa a mai mult de 100,000 de oameni, mai ales evrei si polonezi, proveniti din Vilnius si orasele din apropiere. Masacrul a avut loc in timpul celui de-al Doilea Razboi Mondial.