Universitatea din Pecs a fost fondata de regele Ludovic cel Mare in 1367, avand statutul de cea mai veche institutie de invatamant superior din Ungaria. Ea este formata din Universitatea de Medicina si JPTE, adica Janus Panonius Egyetem. Totusi, universitatea moderna a fost deschisa pe 1 ianuarie 2000, generand un invatamant superior in limba maghiara printr-o gama larga de programe de formare si de grad. Cu peste 29.000 de studenti si aproape 2000 de angajati in randul personalului didactic, universitatea se extinde si dincolo de frontierele orasului, prin programe de transfer si cercetare.