Universitatea Klaipeda este o universitate infiintata in 1991 printr-un decret al Seimului (Parlamentul lituanian), si este cea mai tanara universitate a tarii. Aceasta evolueaza intr-un centru independent de predare si de cercetare orientate spre modelul Universitatii din Vest. Universitatea este capabila de a urmari programele care indeplinesc cerintele de la Universitatile europene si americane. De la trei facultati (umaniste si stiintele naturale, inginerie maritima si pedagogie) si 2.500 de studenti in primul an, Universitatea are acum sapte facultati (facultatile de Stiinte ale Naturii si Matematica, Stiinte Umaniste, Inginerie Maritima, Arta, Pedagogie, Stiinte Sociale si Stiinte Medicale,) si opt scoli numite institute (Institutul Maritim, Institutul de Marina, Institutul de Continuarea Studiilor, Institutul de Cercetare de Coasta, Institutul de Planificare, Institutul de Istorie regiunea Marii Baltice si Arheologie, Institutul de Politici Regionale si Planificare si Institutul de Muzicologie), avand 9.700 studenti. Universitatea are 600 de profesori si ofera 67 de diplome de licenta, 4 de specialitate, 48 de master si 3 doctorate.

Universitatea are un teren de 23, 6 hectare, are sase cladiri neo-gotice care sunt declarate monumente arhitecturale. In prima jumatate a secolului al XX-lea aceste cladiri din caramida rosie, construite intre anii 1904 si 1907, au fost blocuri de locuinta pentru militari, o capela, cantina, un bloc de locuinte pentru ofiteri si un depozit. In diferite perioade a fost un loc pentru trupele germane, franceze, lituaniene si ruse. Cercetarile istorice ale acestor structuri au fost finalizate in 1994.

Universitatea Klaipeda are stabilit biroul de relatii internationale din 1992. Aceasta ajuta la punerea in aplicare a politicii Universitatii in ceea ce priveste relatiile cu institutiile de invatamant superior din strainatate.