Biserica si Manastirea San Francisco reprezinta un complex religios de cult catolic si fosta manastire aflata sub invocarea Sfantului Francisc de Assisi, situata in centrul istoric al capitalei nationale a Chile. Biserica este situata pe bulevardul principal al orasului, intre statiile de metrou Universitatea Chile si Sf. Lucia. Complexul religios este cel mai vechi monument de arhitectura existent in tara, datand din perioada coloniala. In prezent, manastirea este un muzeu cu diverse relicve religioase si arta coloniala.

In 1561, conchistadorul Pedro de Valdivia a fondat Santiago del Nuevo Extremo intre bratele raului Mapocho. Dupa fondarea orasului, Valdivia a cerut Consiliului sa-i vanda un teren pentru a stabili acolo un altar. Consiliul i-a acceptat propunerea si i-a dat pamantul de la marginea bratului sudic a Mapocho. Capela construita a fost administrata de Ordinul Mercy. Aceasta a fost complet distrusa dupa un cutremur care a avut loc in 1583. Ulterior, aici a fost construita o biserica noua finalizata in anul 1613. In anul 1628 au fost construite adiacent doua manastiri.

Biserica a continuat sa se extinda in timpul secolului al XIX-lea cand a fost completat culoarul de sud, iar in 1865 a fost transformata fatada. Ulterior, acoperisul bisericii si al manastirii principale a fost reparat, iar in 1881 a fost inlocuit vechiul altar. In 1895, o capela a fost construita la coltul de nord-est al bisericii. In anul 1960, a fost fondat Comitetul de restaurare a San Francisco si in 1969 a fost deschis Muzeul Colonial San Francisco. Intre 1972 si 1974, au fost restaurate fatada, turnul si corpul bisericii. Restaurarea a continuat in 1986, dupa daunele grave facute de cutremurul din 1985.