Impunatoarea biserica “Sfanta Treime” a fost construita intre anii 1420 – 1514 de catre calugarii franciscani, in anul 1480 construindu-se si capela Sfanta Ana alaturi de biserica. Protestantismul s-a raspandit rapid in Gdansk, iar unul dintre cei mai infocati sustinatori al acestei religii a fost calugarul franciscan Alexandru Svenichen. Insa nu a durat mult raspandirea protestantismului, astfel calugarii au predat manastirea conducerii orasului pentru a o folosi ca un colegiu teologic.Un liceu a luat viata in aceasta cladire care mai tarziu a beneficat si de o biblioteca, fiind dealtfel prima biblioteca a orasului.

Dupa cel de-al doilea razboi mondial, cladirea desi practic ajunsese sa fie o ruina, a fost predata inapoi catolicilor. Biserica are un aspect exterior distinct fata de restul, cu turle gotice ornamentale. Biserica este despartia de capela Sfanta Ana printr-un zid ridicat de catre franciscani. Caracteristic acestei biserici sunt mai multe pietre funerare stabilite in podea si deasemni numeroase lucrari ale unor artisti ai orasului. Simbolurile de pe aceste pietre funerare sunt diverse: lei, dragoni, pasari.

Biserica detine cel mai vechi amvon al orasului, ce dateaza din anul 1541 si reprezinta un exemplu remarcabil de sculptura in lemn. Pe unul dintre culoarele bisericii poate fi vazut mormantul de marmura realizat de catre Avraam van den Blocke in 1597 pentru Giovanni Bernardo Bonifacio, cel care a fondat biblioteca orasului.