Biserica San Esteban este o biserica catolica, construita la sfarsitul secolului al XIII-lea, in stilul gotic, si gazduieste, in prezent, Museo del Retablo. Aceasta are o valoare istorica puternica, fiind una dintre cele mai vechi biserici din Burgos. Biserica este situata in zona de est a provinciei, la intersectia strazilor Valentin Palencia si Pozo Seco din districtul San Esteban. Biserica a fost construita sub domnia lui Alfonso al X-lea, si a fost acceptata de catre Papa Alexandru al III-lea in anul 1163. Datorita apropierii sale de castel, biserica a fost afectata in timpul invaziei franceze in anul 1808, fiind, mai apoi, reconsolidata de catre mari arhitecti precum Simon de Cologne, Nicolas de Vergara, Juan de Vergara. Biserica San Esteban a fost declarata monument national in anul 1931.

Biserica a fost construita cu o bazilica cu 4 sectiuni sustinuta de stalpi cilindrici, care la randul lor au fost intariti de coloane ornamentale. De asemeni, biserica detine si o capela denumita Capela Tuturor Sfintilor, fiind singura biserica parohiala a orasului ce are si capela. Biserica gazduieste Muzeul de altare, in care se pot vedea altare de diferite stiluri si epoci apartinand vechilor biserici ale acestei provincii. Tot aici se pot admira doua picturi locale impreuna cu o frumoasa colectie de tapiserii, si, de asemeni, unele obiecte datand din perioada vizigotilor.