Battistero degli Ariani a fost construit la sfarsitul secolului al V-lea, nu departe de Biserica Duhului Sfant, care a fost candva catedrala a arienilor. La mijlocul secolului al VI-lea, odata cu condamnarea doctrinei ariene, cladirea a fost adaptata la o capela catolica, cu numele de Santa Maria. In timpul Exarhatului, a fost repartizata calugarilor si a luat numele de Santa Maria in Cosmedin. Cladirea este ingropata mai mult de doi metri si este in forma octogonala, cu patru nise in exterior. In cupola, Baptisteriul are mozaicuri fine care descriu botezul lui Hristos si pe cei doisprezece apostoli.

La momentul constructiei, regele gotic Teodoric si-a consolidat puterea si arianismul a devenit religia oficiala a instantei. Potrivit doctrinei Ariene, Hristos a fost Fiul lui Dumnezeu si om adevarat. Mozaicurile din Baptisteriu celebreaza teologia botezului in sensul arian: tanarul Hristos nu este reprezentat ca venind din est, asa cum apare in Baptisteriul catolic. In timp Hristos este infatisat in Baptiseriul catholic Neoniano venind de la est ("Lumina din Lumina, Dumnezeu adevarat din Dumnezeu adevarat"), Hristos Arian este indreptat spre est, devenind divin numai in momentul botezului. Hristos este descris in cupola, ca un tanar aceasta uman, gol, cufundat in apa pana la solduri, cu vintrele descoperite. Erezia ariana nu a supravietuit, dar ramane in aceast baptisteriu imaginea lui Hristos si a Duhului Sfant descrisa in caracterele arienilor.